生物数据库 (Biological Databases) »
miRTarBase
收集实验验证的微小核醣核酸与目标基因间作用关系之数据库。 (Nucl Acids Res, 2011) more . . .
dbPTM
关于蛋白质后转译修饰位点特异性与功能相关性的数据库。 (Nucl Acids Res, 2013) more . . .
RegPhos
探讨人体磷酸化蛋白质激酶-基质的网络。 (Nucl Acids Res, 2011) more . . .
pseudoMap
辨识人体内转录假基因中的微小干扰核醣核酸调和机制。 (Database (Oxford). 2013) more . . .
新世代高通量定序分析工具 (Tools for Next Gen. Sequencing) »
miRExpress
分析微小核醣核酸表现的高通量资料。 (BMC Bioinformatics, 2009) more . . .
miRTarCLIP
利用 CLIP 高通量定序和 PAR-CLIP 高通量定序资料分析来标定微小核醣核酸与目标基因间作用关系。 (BMC Genomics, 2013) more . . .
非编码RNA (MicroRNAs and small RNAs) »
miRTarBase
收集实验验证的微小核醣核酸与目标基因间作用关系之数据库。 (Nucl Acids Res, 2011) more . . .
miRTar
标定微小核醣核酸与目标基因间作用关系之整合性工具 (BMC Bioinformatics, 2011) more . . .
miRStart
人类 miRNA 启动子数据库. (Nucl Acids Res, 2011) more . . .
miRExpress
微小核醣核酸高通量定序数据分析工具。 (BMC Bioinformatics, 2009) more . . .
miRTarCLIP
利用 CLIP 高通量定序和 PAR-CLIP 高通量定序资料分析来标定微小核醣核酸与目标基因间作用关系。 (BMC Genomics, 2013) more . . .
RNALogo
良好地呈现结构性核醣核酸模体之特性。 (Nucl Acids Res, 2008) more . . .
sRNAMap
微生物微小非编码调控核醣核酸数据库。 (Nucl Acids Res, 2009) more . . .
RegRNA
用来找出调控性 RNA 扮演的角色以及功能性 RNA motif 的强化计算平台。 (Nucl Acids Res, 2006, BMC bioinformatics, 2013) more . . .
RiboSW
根据 RNA 结构及保留的功能性序列发展出的 riboswitches 计算鉴别法。 (RNA, 2009) more . . .
ViTa
病毒上的 microRNA 目标数据库。 (Nucl Acids Res, 2007) more . . .
miRNAMap
后生动物基因体里的 microRNA 地图。 (Nucl Acids Res, 2006, Nucl Acids Res, 2008) more . . .
RNAMST
高效率且灵活辨认结构性同源 RNA 的方法。 (Nucl Acids Res, 2006) more . . .
蛋白质后转译修饰 (Protein Post-translational Modifications) »
dbPTM
关于蛋白质后转译修饰位点特异性与功能相关性的数据库。 (Nucl Acids Res, 2013) more . . .
RegPhos
探讨人体磷酸化蛋白质激酶-基质的网络。 (Nucl Acids Res, 2011) more . . .
KinasePhos
辨认蛋白质上特定蛋白激酶磷酸化点位的网络工具。 (Nucl Acids Res, 2005, J. Comp. Chem. 2005) more . . .
KinasePhos (ver. 2)
一个以序列及耦合的模式来辨认蛋白质上的激酶磷酸化位置的网站。 (Nucl Acids Res, 2007) more . . .Sulfosite
透过整合向量支持机以辨认蛋白质上的酪氨酸硫酸化位置。 (J Comput Chem. 2009) more . . .
MASA
透过整合结构特征以辨认蛋白质甲基化的位置。 (J Comput Chem. 2009) more . . .
N-ACE
以溶剂可溶性和物理化学性质来辨认蛋白质上的N端乙酰化位置。 (J Comput Chem. 2010) more . . .
dbSNO
一个有关半胱氨酸上的硫基亚硝酸化的数据库。 (Bioinformatics. 2012) more . . .
SNOSite
利用最大依赖分解度来辨认半胱氨酸上的硫基亚硝酸化与基质位置特异性。 (PLoS One. 2011) more . . .
基因调控与后转录调控 (Gene Regulation and Post-transcriptional Regulation) »
PlantPAN
植物启动子分析工具。 (BMC Genomics, 2009) more . . .
SpliceInfo
人类基因体选择性剪接模式数据库 (Nucl Acids Res, 2005) more . . .
ProSplicer
人类基因体选择性剪接数据库。 (Genome Biology, 2003) more . . .
合成生物及系统生物学 (Resources for Synthetic Biology and Systems Biology) »
FMM
生物体代谢路径的重建及比较分析工具。 (Nucl Acids Res, 2009) more . . .
RegPhos
探讨人体磷酸化蛋白质激酶-基质的网络。 (Nucl Acids Res, 2011) more . . .
sRNAMap
微生物微小非编码调控核醣核酸数据库。(Nucl Acids Res, 2009) more . . .
ProKware
一个整合性工具展示蛋白质性质于蛋白质三级结构中。 (Nucl Acids Res, 2006) more . . .